目前岩藻糖苷贮积症无法快速治愈，以对症治疗为主，综合治疗可改善症状和预后。
岩藻糖苷贮积症是一种罕见的遗传性脂质贮积病，因 α- 岩藻糖苷酶缺乏，致使岩藻糖不能正常代谢而在体内蓄积，损害细胞、组织和器官。由于该病罕见且机制复杂，尚无特效快速疗法，需综合多种手段治疗。
一、对症治疗
根据患者症状给予相应治疗，以缓解痛苦、提高生活质量。
- 感染防治：患者易反复呼吸道等感染。一旦发生，需及时使用抗生素，如阿奇霉素、头孢曲松、头孢噻肟（针对细菌感染），阿昔洛韦（针对病毒感染）。治疗前先经验性用药，后依病原学及药敏结果精准用药。
- 营养支持：保证充足营养，补充优质蛋白（如牛奶、鱼肉、豆制品）和多种维生素，少食多餐，限制脂肪摄入。必要时采取肠内或肠外营养，维持患者营养状态。
- 骨骼畸形矫正：儿童患者若出现骨骼畸形，可进行手术矫正，年龄较小者效果相对较好。
- 其他症状处理：针对肌痉挛，可按摩等缓解；严重贫血或出血者，输血治疗；听力下降者，使用助听器或植入人工耳蜗；积极防治心脏并发症。
二、酶替代治疗
通过定期输注修饰后的岩藻糖苷酶，补充患者体内缺乏的酶，清除蓄积岩藻糖，减轻症状、延缓疾病进展。但该疗法需终身进行，且可能有免疫原性风险，部分患者免疫系统会识别外源性酶为抗原，产生抗体影响疗效。
三、造血干细胞移植
包括异基因骨髓移植和异基因脐血造血干细胞移植。移植正常含 α- 岩藻糖苷酶基因的干细胞，分泌正常酶补充患者所需，延缓病程，一定程度保留认知和心肺功能。不过目前病例为个案报道，虽有进展但需更多研究验证。移植后需使用环孢素、甲氨蝶呤等免疫抑制剂，降低免疫排斥风险。
四、饮食控制
限制含岩藻糖食物摄入，如某些糖果、糕点，减少岩藻糖来源，降低体内岩藻糖苷蓄积，缓解症状。但饮食控制不能替代其他治疗方法。
岩藻糖苷贮积症治疗是长期过程，需综合对症治疗、酶替代治疗、造血干细胞移植及饮食控制等多种手段。患者应积极配合医生，定期复诊，根据病情调整方案，以改善生活质量、延长生存期。