云南最好的中医院需结合医院综合实力、学科建设及特色专科等多方面因素综合评估，以下为综合推荐结果：

一、综合实力领先的省级中医医院

1. 云南省中医医院

   • 云南省唯一省级中医医院，始建于1947年，是三级甲等中医医院，拥有滇池、光华两个院区，管理运行模式涵盖六块牌子一套班子。 - 设有23个临床科室、20个行政职能科室及11个医技科室，是国家级中医药知识与技能培训示范基地、国家药物临床试验机构等。

2. 云南中医药大学第一附属医院

   • 与云南省中医医院合并管理，中医内科、妇科、针灸科等学科优势显著，承担多项国家级科研项目。

二、地区性特色突出医院

1. 昆明市中医医院

   • 云南中医药大学第三附属医院，集医疗、教学、科研于一体，设有针灸科、脾胃病科等省级重点专科，中医特色突出。

2. 曲靖市中医医院

   • 以中医药为主、西医药为辅的综合性医院，是国家级中医住院医师规范化培训基地，擅长中医骨伤、中医肛肠等专科。

3. 文山州中医医院

   • 文山唯一三级甲等中医医院，专注风湿痹痛、中医脑病等领域的诊疗，结合传统疗法与现代技术。

4. 昭通市中医医院

   • 国家级中医药文化宣传教育基地，中医住院医师规范化培训基地，以中医内科、妇科见长。

三、其他推荐医院

• 玉溪市中医医院 ：在中医脾胃病、肺病方面有丰富经验。

• 楚雄彝族自治州中医医院 ：结合彝族医药特色，中医内科、外科诊疗水平较高。

• 大理白族自治州中医医院 ：以中医妇科、儿科为特色，传承白族医药文化。

四、选择建议

• 就医需求导向 ：若需全省权威医疗资源，优先考虑云南省中医医院；若侧重中医专科，可结合区域医院特色选择（如昆明市中医医院、曲靖市中医医院等）。

• 挂号方式 ：可通过医院官网、电话或第三方平台（如云医挂号）预约，部分医院需提前确认挂号信息。

注：医院排名仅供参考，具体选择需结合患者病情、地理位置及医保覆盖等因素综合判断。