职工基本医疗保险单位缴纳的钱主要进入了以下部分：
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社会医疗保险统筹基金：单位缴纳的大部分医保费用会进入统筹基金账户。这部分资金由社保中心或医保中心进行管理，主要用于支付参保人员的特殊病种门诊费用、住院医疗费用中属于基本医疗保险支付范围的费用。例如，在三甲医院住院花费5万元，医保可报销70%（约3.5万元），这部分报销费用就是从统筹基金中支付。
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个人账户：单位缴纳的医保费用中，有一部分会按照一定比例划入职工的医保个人账户。不同地区会根据年龄等因素调整划入比例，如上海35岁以下划入20%，35-50岁划入30%，50岁以上划入40%。个人账户的资金可以用于在定点药店买药、支付门诊费用及门诊自付部分等。
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医保管理和服务费用：有一小部分用于医保经办机构的运营和管理，包括人员工资、办公经费等，以确保医保政策的执行、参保登记、费用审核、待遇支付等工作的顺利开展。还会用于医保政策的宣传和培训，以提高参保人员和相关机构对医保政策的了解和执行水平。
职工医保单位缴纳的钱分别进入了社会医疗保险统筹基金、个人账户以及用于医保管理和服务，这些部分共同构成了职工医保基金，为保障参保人员的医疗需求发挥着重要作用。