根据2024年最新个人所得税法及搜索结果，山西晋中社保基数为12500元时，扣除五险一金后的应纳税额计算如下：
一、扣除项目与标准
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五险一金扣除比例
晋中五险一金个人缴纳比例通常为：养老保险8%、医疗保险8%、失业保险0.5%、工伤保险0.2%、生育保险0.2%、住房公积金12%。
- 五险一金合计扣除比例：8%（养老+医疗）+0.5%（失业）+0.2%（工伤）+0.2%（生育）+12%（公积金）= 30% 。
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个税起征点
2024年个税起征点为5000元，且存在专项附加扣除项目（如子女教育、住房贷款等）。
二、应纳税所得额计算
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月工资 ：12500元
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扣除五险一金 ：12500元 × 30% = 3750元
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应纳税所得额 ：12500元 - 3750元（社保） - 5000元（起征点）= 3750元 。
三、适用税率与速算扣除数
根据2024年税率表，3750元属于 第三档 ，适用 10%的税率 和 210元的速算扣除数 。
四、应纳个人所得税计算
$$ \text{应纳个税} = 3750 \text{元} \times 10% - 210 \text{元} = 165 \text{元} $$
五、注意事项
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专项附加扣除 ：若存在子女教育、房贷等专项附加扣除，可进一步减少应纳税所得额。
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地区差异 ：建议结合当地最新社保基数和政策确认具体扣除比例。
月工资12500元（晋中社保基数） ，扣除五险一金和个税起征点后， 应纳个人所得税为165元 。